| ř. km. | úsek | stáří kilometráže |
|---|
| 396,5 - 361,9 |
Lenora - Hory |
neprověřeno, cca 1998 |
| 319,1 - 284,2 |
Vyšší Brod (hráz VD Lipno II) - Český Krumlov |
srpen 2016 |
| 284,2 - 243,5 |
Český Krumlov - Rožnov (České Budějovice) |
říjen 2021 |
| 243,5 - 225,3 |
Rožnov (České Budějovice) - začátek vzdutí VD Hněvkovice |
srpen 1998 |
| 225,3 - 202,2 |
začátek vzdutí VD Hněvkovice - ústí Lužnice |
neprověřeno, cca 1998 |
| 202,2 - 181,0 |
ústí Lužnice - Červená n. V. |
srpen 2000 |
| 181,0 - 169,1 |
Červená n. V. - Zvíkov |
neprověřeno, cca 1998 |
| 169,1 - 17,0 |
Zvíkov - Miřejovice |
srpen 2001 |
| 17,0 - 0,0 |
Miřejovice - ústí do Labe |
neprověřeno, cca 1998 |